Банкротство компании было инициировано самим ЗАО в январе 2009 года. В марте 2009 года компанию признали несостоятельной, и конкурсным управляющим стал Алексей Копылов. После этого конкурсное производство продлевалось четыре раза — в сентябре 2009 года, в марте и сентябре 2010-го и в марте 2011 года. 26 августа областной арбитраж по ходатайству Копылова вновь продлил действие процедуры конкурсного производства. На этот раз причиной стало оспаривание конкурсным управляющим сделок и попытки вернуть имущество «Аликор Трейда» — свинокомплекс в поселке Кировский Красноармейского района. На сегодняшний день задолженность «Аликор Трейда» составляет более 2 млрд рублей.