Повод для спора был создан еще в 2010 году, когда учреждение — тогда еще муниципальное — занимало на Третьей просеке, 157 участок площадью 16 851 кв. м. Городские власти разделили его на две части, освободив от строений меньшую по площади — в 4303,7 кв. м. В 2013 году все медучреждения были переданы на уровень региона. Однако этот участок передавать области в мэрии посчитали нецелесообразным, именно ввиду того, что на нем уже не было никаких объектов недвижимости, используемых больницей. В ответ 30 августа 2016 года министерство имущественных отношений региона обратилось в самарский арбитраж, требуя признать бездействие муниципалитета незаконным и понудить его к передаче оставшихся площадей больницы субъекту Федерации. В итоге суды и областного, и последующих арбитражных судебных инстанций признали правоту министерства. В числе доводов было указано, в частности, что эта территория используется как садово-парковая зона, необходимая при инфекционном стационаре больницы. Этого требуют СанПиНы. Данные нормы требуют также выдерживать расстояние минимум в 100 метров от жилой застройки, не располагать на участке здания и сети, не связанные с деятельностью лечебного учреждения.