Банкротство в отношении ВУСУ было открыто в августе 2004 года. В 2006 году на предприятии решением суда введена процедура наблюдения. Почти 100% кредиторской задолженности управления составляли долги перед налоговыми органами. В сентябре 2005 года о намерении быть включенным в список кредиторов ВУСУ заявила войсковая часть №83406. Требования части составили 19,479 млн рублей, 17,7 млн рублей из которых приходилось на задолженность ВУСУ по государственному контракту от 2003 года на выполнение оборонного заказа на капитальное строительство, а 1,7 млн рублей — долг по договору долевого участия на строительство жилого дома от 2001 года. В феврале 2006 года иск кредитора был частично удовлетворен, однако размер требований был снижен до 1,7 млн рублей. В конце марта войсковой части удалось опротестовать решение первой инстанции в апелляции, обосновав свою позицию тем, что судом при вынесении определения были неполно выяснены существенные обстоятельства дела. По информации «СО», дело направлено на новое рассмотрение в суд первой инстанции.